Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930449I24RikQ9D5E3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms