Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc130Q9D516 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc130Q9D516 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms