Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrameQ9D4Z5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrameQ9D4Z5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms