Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms