Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Odf2lQ9D478 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Odf2lQ9D478 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms