Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt20Q9D312 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt20Q9D312 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt20Q9D312 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt20Q9D312 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt20Q9D312 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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