Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tssk3Q9D2E1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tssk3Q9D2E1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms