Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D131 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D131 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D131 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D131 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D131 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D131 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D131 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D131 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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