Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pbdc1Q9D0B6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pbdc1Q9D0B6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pbdc1Q9D0B6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms