Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CYI0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q9CYI0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CYI0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms