Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssr1Q9CY50 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssr1Q9CY50 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssr1Q9CY50 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms