Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem175Q9CXY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem175Q9CXY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms