Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
3100002H09RikQ9CXW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
3100002H09RikQ9CXW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms