Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl11Q9CXW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl11Q9CXW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms