Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih4Q9CX13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih4Q9CX13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms