Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RpainQ9CWY9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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