Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx47Q9CWX9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx47Q9CWX9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Ddx47Q9CWX9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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Ddx47Q9CWX9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Ddx47Q9CWX9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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Ddx47Q9CWX9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx47Q9CWX9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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