Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Malsu1Q9CWV0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms