Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd12Q9CWU0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd12Q9CWU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms