Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx10Q9CWT3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx10Q9CWT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms