Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NubplQ9CWD8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NubplQ9CWD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.1 ms