Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhfpl3Q9CTN8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhfpl3Q9CTN8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhfpl3Q9CTN8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms