Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms