Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm4sf20Q9CQY8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tm4sf20Q9CQY8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm4sf20Q9CQY8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tm4sf20Q9CQY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms