Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccer1Q9CQL2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccer1Q9CQL2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms