Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab5aQ9CQD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms