Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921530L21RikQ9CQ47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921530L21RikQ9CQ47 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4921530L21RikQ9CQ47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms