Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
StambpQ9CQ26 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms