Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpd52l3Q9CQ14 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpd52l3Q9CQ14 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms