Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp3Q9CQ10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp3Q9CQ10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp3Q9CQ10 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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