Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg3Q9CPX6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atg3Q9CPX6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms