Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bap1Q99PU7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bap1Q99PU7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bap1Q99PU7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms