Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms