Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arl4dQ99PE9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms