Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bco2Q99NF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bco2Q99NF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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