Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac9Q99N13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac9Q99N13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac9Q99N13 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms