Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.5 ms