Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramel1Q99MW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramel1Q99MW3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pramel1Q99MW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms