Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnpo2Q99LG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms