Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp16Q99LG0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp16Q99LG0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms