Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ciao1Q99KN2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ciao1Q99KN2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ciao1Q99KN2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms