Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn2aQ99KJ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms