Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd6Q99JI4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psmd6Q99JI4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd6Q99JI4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd6Q99JI4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms