Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnip2Q99JG7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnip2Q99JG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnip2Q99JG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms