Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GhdcQ99J23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GhdcQ99J23 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GhdcQ99J23 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms