Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn16Q925N4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Cldn16Q925N4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Cldn16Q925N4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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