Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SptssbQ925E8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SptssbQ925E8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms