Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg2Q925E0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg2Q925E0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg2Q925E0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms