Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Letmd1Q924L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Letmd1Q924L1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms