Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim7Q923T7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim7Q923T7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim7Q923T7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms